Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac10Q6P3E7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms