Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RbfaQ6P3B9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms