Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HelbQ6NVF4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms