Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa13Q62424 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Hoxa13Q62424 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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