Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sema3cQ62181 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sema3cQ62181 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms