Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
L1td1Q587J6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms