Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms