Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upf3bQ3ULL6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms