Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms