Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shcbp1lQ3TTP0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms