Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fbxw18Q3TSA9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms