Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms