Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gbp8Q2V6D6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp8Q2V6D6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp8Q2V6D6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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