Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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