Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rundc1Q0VDN7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms