Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntn3Q07409 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms