Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddr1Q03146 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.6 ms