Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sec23aQ01405 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms