Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc8a1P70414 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc8a1P70414 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms