Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snap25P60879 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms