Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psen1P49769 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psen1P49769 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psen1P49769 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psen1P49769 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psen1P49769 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms