Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rab11bP46638 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms