Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sstr1P30873 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms