Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd10P28359 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd10P28359 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms