Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irf8P23611 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irf8P23611 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms