Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gja1P23242 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms