Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CrygdP04342 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CrygdP04342 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms