Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek2O35942 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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