Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clk2O35491 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms