Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Casq1O09165 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Casq1O09165 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Casq1O09165 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms