Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5225J3QPL3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm5225J3QPL3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5225J3QPL3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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