Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Top6blJ3QMY9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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