Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rdh16f1E9Q9P8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms