Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph10bE9PYQ0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms