Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Samd1D3YXK1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms