Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol6B7ZC55 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms