Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
DUSP13Q9UII6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUSP13Q9UII6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms