Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms