Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efcc1Q9JJF6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms