Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms