Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cxcr6Q9EQ16 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cxcr6Q9EQ16 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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