Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syde1Q9DBZ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde1Q9DBZ9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms