Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnpy3Q9DAU1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnpy3Q9DAU1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms