Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
4933428G20RikQ9D3X4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms