Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfc5Q9D0F6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms