Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnih4Q9CX13 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Cnih4Q9CX13 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnih4Q9CX13 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Cnih4Q9CX13 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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