Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms