Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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