Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snrnp27Q8K194 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snrnp27Q8K194 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Snrnp27Q8K194 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snrnp27Q8K194 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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