Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFU8

Tp53inp2, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53inp2Q8CFU8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tp53inp2Q8CFU8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms